1920年7月，以段祺瑞为首的皖系军阀和以吴佩孚、曹锟为首的直系军阀，为争夺北京政府统治权，在京津地区发动战争。这次直皖战争历时五日，皖军大败，段祺瑞被迫辞职，直、奉两系军阀遂控制了北京政权，共推靳云鹏担任内阁总理。京津地区的政局暂时稳定下来。
这时正值暑假，熊子真辞掉南开学校的教师工作，回到德安。妻子傅既光关心地问：“子真啊，是不是在南开学校过得很苦？”
“过得很好。”熊子真望着妻子，坦然地说，“我辞职不是因为过得不好，是因为我想重新去做一回学生。”
傅既光疑惑地望着丈夫。熊子真展颜一笑，说：“过两个月，我准备到南京去拜师学佛。”
“学佛？”傅既光更加疑惑了，问道，“你从前毁佛，现在学佛，脑子没病吧？”
熊子真哈哈大笑，朗声说道：“此一时，彼一时，没什么可大惊小怪的。”
“你呀，就是一个不安生的人！”傅既光说。
不久，熊子真要到南京学佛的消息从德安传到黄冈，那里的乡亲们也都深感意外。因为在人们的记忆中，熊子真自小就是一个不信佛、不敬佛的人，曾经冒天下之大不韪，鞭打过菩萨，偷取过金佛，怎么突然之间就要去学佛呢？这个弯似乎转得太大了一些。当然，普通人不可能理解熊子真内心的追求。
这年9月，跟家人进行了一番交代后，熊子真卷起铺盖，只身来到南京金陵刻经处，拜在欧阳竟无大师的门下，潜心学佛。
欧阳竟无，又名欧阳渐，1871年出生于江西宜黄县，是中国近现代著名的佛教居士，佛学教育家，唯识宗代表人物。欧阳竟无六岁丧父，1890年捐得秀才，后进入南昌经训书院，专攻汉学，兼修天文学和数学。中日甲午战争的失败对欧阳竟无触动很大，使他转而研究陆象山、王阳明的学说，希望从陆王心学中寻求救国之道。
1904年，欧阳竟无在南京拜访了金陵刻经局的杨仁山先生，受其影响而开始学佛。不久，欧阳竟无回到江西宜黄，创办诚志学堂。1906年，母亲病故后，欧阳竟无悲痛欲绝，立誓成为一名佛教居土，也就是不出家的修行者。按当时教规，居士应该断绝肉食，不进仕途，因而他隐居在九峰山，为母亲守丧，以求顿觉。1907年，欧阳竟无到南京跟从杨仁山学习，不久，在杨仁山劝说下，赴日本学习密宗佛法，在东京结识章太炎和刘师培等人，一同探究佛法。1908年回国，在广州优级师范学堂教书。
1910年，欧阳竟无再度赴南京从杨仁山学唯识宗。1911年，杨仁山病故，欧阳竟无承其遗志，接任金陵刻经局编辑事宜，经营刻经处，并附设佛学研究部。1918年，欧阳竟无和章太炎、陈三立等人在金陵刻经处的基础上，筹建支那内学院，也就是佛学院。因为古印度称中国为支那，佛教自称其学为内学，因此而得名。内学院由欧阳竟无主讲《唯识抉择谈》《大藏经》、“四书”“五经”等经典。
那天，熊子真背着一个破旧的行李包，在金陵刻经处研究部办理完入学手续后，被工作人员安排到一间低矮的平房宿舍中。从这天起，熊子真就开始了长达两年多的苦学生活，除了过年的时候与家人团聚外，再没有离开一步，完全像一个苦修的僧人。
当一个人把全部的心思都灌注于学习和思考的时候，那些思维活动之外的一切东西似乎都不再重要，比如，住的、吃的、穿的，哪怕仅仅维持在极低极低的水平，也都是可以毫无怨言地接受的。熊子真就是如此。
首先说住的。熊子真的那间宿舍不仅低矮，而且潮湿，除了一张木板床，一套破旧课桌椅，再无它物。但是，熊子真并不介意，把带来的旧被褥往木板**一铺，就能睡得鼾声如雷。再说穿的。在欧阳竟无大师众多弟子中，熊子真是最穷的一个，当时他只有一条中装长裤。有一段时间，他一直穿着那条裤子去听课，去吃饭，去请教学长，一天，两天，三天……裤子已经脏兮兮了，也没得换。怎么办？他便利用晚上时间，赶着把裤子洗净，挂在通风处晾干，第二天接着再穿。有时候碰到阴天，裤子没干，他就光着腿，罩上长衫。久而久之，大家都戏称他为“空空道人”。吃的也是极为简单，不仅没有沾过荤腥，连像样的素食餐都很少吃到，有时读书至深更半夜，熊子真肚子饿得实在受不了，就猛喝开水以充饥。没有热水洗澡，他就干脆进行冷水浴。
但是，在学习上，熊子真却丝毫不马虎。每天早晨四点，他准时起床，或读书，或写作，从不耽误。由于天没有亮，很多时候，他就站在路灯底下“借光”。由于用功过度，他一度患上神经衰弱症，出现严重的睡眠障碍和头痛等症状。即便如此，他还是忍着头痛，坚持研读经书，或是做读书笔记。就是凭着这股子精神，在不到三年的时间里，他把派别众多、卷帙浩繁、深奥难解的佛教经书全都钻研了一遍，写下了数十万字的读书笔记。
有一天，熊子真正在自己的宿舍苦读，欧阳竟无找上门来。这令熊子真深感意外，自入学以来，欧阳大师并没有重视过他，也没有同他单独说过话。其实，熊子真有所不知，这次欧阳大师到访，也算是“慕名而来”，因为欧阳大师听说自己的弟子中有一个叫熊子真的，曾经获得蔡元培先生的赏识，并为其作序，便决定见一见这个弟子。
欧阳大师扫视了一下简陋的宿舍，问道：“作为读书之人，你这里怎么没有藏书？”
熊子真拍了拍自己的脑袋，笑着回答：“先生有所不知，我的书全藏在这里了。”
欧阳大师显然有点不高兴，他不喜欢弟子吹牛，便问道：“哦？那么，你说来听听，究竟藏了些什么书？”
“回先生的话，我这里有《般若经》六百卷，还有《大智度论》一百卷、《大昆婆沙论》两百卷，在加上《四阿含经》一百八十一卷和《瑜伽师地论》一百卷，都在我的脑子里藏着呢。”熊子真自信地说，“不仅装有这些佛经，我还有一些读经笔记，正想请先生指点呢。”说着，熊子真把自己的读书笔记从课桌的抽屉里拿出来，捧给欧阳大师看。
欧阳并没有多说什么，拿了读书笔记，转身离去。别看大师此次不动声色，其实，从此以后，他对这个名叫熊子真的弟子相当器重。
可是，令欧阳竟无万万没有想到的是，熊子真并不是一个只知道匍匐在学术大师脚下的恭顺弟子，而是一个充满挑战精神的叛逆者。这是后话。
实事求是地说，在欧阳竟无门下两年多的求学，熊子真接受了严格的理性思辨的训练，为其最终成为学术大师奠定了坚实基础。