皇帝以下，中央設置三公九卿。石本是計量單位，漢代專指官吏秩級，以計俸祿。漢官吏秩共十八等，秩越高，祿也越高。
一、三公
三公謂丞相、禦史大夫與太尉：丞相掌全國政務；禦史大夫輔助丞相，主監察執法並掌管圖籍；太尉督理全國軍事。
1.丞相
丞相居百官之首，俸祿最高，掌佐天子，助理萬機。金印紫綬，秩俸萬石。
丞相府主要官吏：丞相司直，輔佐丞相，檢舉不法，秩俸千石；丞相長史，輔佐丞相，督率諸吏，處理各種政務，秩俸比千石；丞相史，秩俸四百石；丞相少史，秩俸三百石。
2.太尉
太尉專掌武事，地位和丞相相同，為最高的武官職位，秩俸萬石，金印紫綬。主要是充當皇帝的最高軍事顧問，多半不直接領兵。漢武帝建元二年（公元前139年）後不再設置。後武帝改太尉為大司馬，作為大將軍、驃騎將軍的加號。
3.禦史大夫
行使副丞相的職權，是丞相的助理，三公中地位最低。秩俸二千石，銀印青綬。
二、九卿
九卿是指太常，光祿勳，衛尉，太仆，廷尉，大鴻臚，宗正，大司農，少府九個機構。同時執金吾，大長秋，將作大匠的地位和秩俸都與九卿相同，因此把他們和九卿統稱為諸卿。京北尹、右扶風、左馮翊是三輔即京師地區的地方行政長官，有資格參加朝議，具有高於一般郡國長官的特殊地位，因此也得以列於諸卿。
1.太常
太常原名為奉常，漢朝景帝時改名為太常。掌宗廟事，一般不參加具體的行政事務，是九卿之首。秩俸中二千石，銀印青綬。
太常機構主要官吏：太常丞，秩俸千石，銅印黑綬，掌凡祭祀及行禮之事，總署曹事，典諸陵邑；太常掾，秩俸四百石，銅印黑綬，助太常丞；太史令，秩俸六百石，銅印黑綬，掌天時、星曆；太史丞，秩俸四百石，銅印黑綬，輔佐太史令；侍詔，秩俸二百石，分掌星曆，龜卜，請雨事；治曆，主曆法。