备课是课堂教学顺利实施的前提和保障，传统纸质化的备课方式显然与数字化教学比较脱节，不利于电子教材内容与数字教学资源的整合应用。采用电子备课方式则使两者在数字层面上实现了对接和贯通。
教师可以利用电子教材中教学管理平台的备课应用，将资源库中的资源进行优选、改造和组合，并按需开发课件资源，再把这些资源利用电子教材备课系统工具软件有机整合在一起，形成切合师生特点和需求的课堂教学资源。这种备课方式的好处较多：一是提高了备课的效率；二是将电子教材内容与补充的教学资源有机整合在一起，避免教学资源与教材内容的割裂，使两者都能够得到充分地应用；三是将“备”和“教”结合在同一平台、同一终端设备；四是更便于将备课资源与学生、同事进行交流分享。
需要强调的是，以上列举的一些教学方式都不是电子教材带来的全新事物，在没有电子教材的信息技术环境中它们都已经得到一定的应用和推广，电子教材所起的作用是对这些方式的增强、整合，使之系统化、一体化于电子教材这个教学的核心工具之上，使之能够被应用得更加自然、顺畅，更能产生实效。