天台宗禪教並重，其教號為大乘圓教，特重《法華》，故又號法華宗。其禪法事實上仍是以五門禪法為主，兼具法華三昧等念佛法門，故其禪教源流不同，也始終未能融為一體。智者大師所述三種止觀等禪法皆屬五門禪法與念佛三昧，後世亦未有所突破。對於這一事實，天台宗後世也是承認的。元懷則《天台傳佛心印記》解釋此事雲，以六識心為所觀之境正合近要，觀緣九識真心如用藕絲懸山，無有效驗。
天台宗義以“性具”為本，一念三千，無所不包，善惡染淨諸法，俱在此一念心中。禪宗言自性具足，強調的是自心具足一切淨法，而天台宗則強調自心同樣具足染法，立說趨於極端。為了說明成佛的可能性，涅槃佛性係經典說闡提不斷性善，一切眾生皆有佛性，都有見性成佛的可能，諸多大乘經典都強調世間與涅槃、眾生與佛之間並無不可逾越的距離，這都是為了使眾生相信自己身心之中有佛性種子，具有解脫成佛的可能。而台家卻從另一角度說明眾生與佛之間無距離，不論般若類還是涅槃類大乘經典都強調眾生與佛無差別，將眾生引向佛，台家卻獨具新見，反過來說佛不斷性惡，佛與眾生無別，將佛引向眾生。或謂佛唯具性惡，不起修惡，故有惡性而無惡行，但即如此，也難免走向歧途。言眾生是佛，闡提不斷性善，是為引導眾生自信自悟、自修自度，既具暢明大智，又攝無緣大悲，而言佛是眾生，佛不斷性惡，除了在理論上說明佛具足一切的周遍性之外，又有什麽實際意義呢？台家本義也許不是令諸佛下降為眾生，隻是為了說明性具之理，說明諸佛心性圓滿具足、無欠無缺，且遠離善惡、染淨分別二見，雖具性惡而自無染，自由自在，在染不汙，神通遊戲，無量妙用。但如此立說總會有損佛法，在理論上未必稱得上突破，在實踐上則更為有害。如此隻強調諸佛的普遍性而不顧其殊勝性，眼界已然有偏，雖然博得一時新奇之名，又如何能真正立足呢！