企业在自主创新过程中，首先要明确自身发展的方向，需要结合自身的技术优势，选择一条符合企业特点的创新之路。企业不能为了得到国家的一些政策优惠，而不顾自身创新能力的大小，盲目上项目，这样不但不能带来有效的技术创新，反而会引起巨大成本，甚至引起企业的倒闭。其实，企业自主创新所涉及的范围非常宽泛，只要能给企业带来新价值的技术变革，都应是自主创新。企业需要做的是选择一个适合自身优势的创新方向。具体来讲，企业需要从技术的产业布局，技术用途和技术含量三个方面认真考虑后做出创新方向的选择。
从技术的产业布局考虑，企业的自主创新有三个方向。第一，传统技术方向。企业的产品为传统产品，主要生产技术已基本定型，很难有突破性提高。企业的技术目标主要是降低单位成本、提高产品质量、形成生产和技术标准、完善售后服务等。选择传统技术方向，并不等于摒弃技术进步，而是基于传统技术的不断发展。这种发展和创新可能是缓慢和不显著的，但长期的积累会产生惊人的效应。如钢铁冶金行业，虽然几十年来主要的产品和生产技术并无根本改变，但操作的自动化、精密化程度已不可同日而语，产品质量有了飞跃性的提高。第二，高新技术方向。高新技术是一系列新技术、新领域的总称，包括信息技术、现代生物技术等。一般来说，高新技术在其发展过程中有两个方向，一个是用高新技术改造传统产业，另一个是高新技术本身的产业化。第三，混合型技术方向。创新的方向也会以混合形态出现，高新技术与传统技术有机结合在一起，产生一个同时涵盖高新技术和传统产业的新产业。
从技术用途考虑，企业的自主创新有两大方向。第一，克服负效应的技术开发。主要是从一种新技术产生的社会不良后果出发，力争将负效应转变为积极效应。在技术开发中，技术上获得成功但总体上遭受失败的教训不胜枚举。比如20世纪40年代，米勒发明了高效杀虫农药DDT，获得了1948年诺贝尔生理学和医学奖，但到了70年代，DDT引起了严重污染，人们不得不停止生产这种农药。这些问题不是来自技术本身，而是受到自然规律的作用，带来环境、社会、经济等方面的压力。克服负效应的技术开发，主要是提高产品的技术含量，减少产品的有害性，增加产品的适应性从而开拓市场。第二，需求满足型技术开发。主要是致力于加速产品的更新换代，扩大产品的花色品种，提高产品的使用性能，将各种领域的新技术向日用消费领域转移，从而换取巨大的经济效益。除了关注科学技术的重大突破外，还应关注技术对需求的推动作用。我国目前有效需求不足的一个重要原因，就是缺乏刺激需求的技术创新，导致一些有钱人在现有的技术水平下没有消费。
从技术含量状况考虑，企业的自主创新有三个方向。第一，独创型技术开发，是对基础研究的应用、发展与拓广，是建立在成熟的理论研究基础上的技术开发。独创性技术开发往往形成的是核心技术和关键技术。一个国家要成为真正的科技大国和经济大国，必须在这一领域投入主要力量。第二，综合型技术开发，是指利用现有的技术，创造出具有新功能的生产能力以及新产品。在新的科学技术原理没有突破的条件下，谁能把已有的科学原理综合起来，谁就能出奇制胜。第三，引进吸收再创新型技术开发，是指在引进或模仿技术领先企业的技术后，不断加以改造，进行技术的再创新。具体可以从以下三个方面入手：第一，技术的本土化改造；第二，在原有技术基础上进行创新，完善运行中暴露出的弊病；第三，在引进技术获得成功后，开发层次更高、性能更优、更符合市场需求的技术和产品。