監國之立，由浙東文士，不習兵事，而擁兵者為方國安、王之仁。之仁雖忠烈，卒能殉國，然其爭餉自擅，固武夫恒態，義師為所窘而潰，數月間事耳。其間已用閹人，徇外戚，無大誌可知。頒曆、鑄錢等事，行之井井，固文人之所為也。
監國元年，隆武二年，清順治三年。正月，遣使奉書入閩。三月，諜言清兵由海道來，移肅樂守海口，久之無所得餉，乃與孫嘉績合疏請以兵歸武臣，身並從軍自效，溫旨慰留。諸帥嫉甚，誣其貳於閩，遣客刺之。肅樂乃棄軍拜表行，監國駭歎，令往海上偕石浦、舟山鎮將張名振、黃斌卿等作窺吳計。清兵入錢塘，國維、之仁拒之，獲勝，遂圍杭州，不克而還。隆武帝亦遣使來犒師，為方國安部兵所殺。或曰馬、阮嗾國安為之，構閩、浙之隙。乃命國維分兵備閩。四月，清兵隔江炮擊國安營，破其廚灶，國安以為天奪其食，遽拔營走紹興，劫王南行，將投閩，而馬、阮銜弗納之怒，勸獻監國降清，遣人守監國。守者病，監國得脫，趨海門航海去。國維退守東陽，江上師盡潰，時新舉義者紛集，亦皆散去。清兵取紹興，士大夫抗節死者甚眾。義烏亦破，國維死之。王之仁入海，沉其妻孥，由鬆江至南京，抗言於洪承疇而死。朱大典守金華不下。國安、馬、阮降清，為清兵攻金華。大铖先在金華被逐，知其城有不固處，導國安炮攻之，遂陷，大典發火藥全家自焚死。監國出海時，石浦守將張名振以舟師扈行。至舟山，黃斌卿不納，乃入閩。時福京已陷，隆武帝已殂，鄭彩以軍入海。十一月，監國至廈門，鄭芝龍已投清，令彩執監國歸順，彩不可。既而成功起兵海上，亦駐廈門，意不欲奉監國，仍用隆武年號，鄭彩乃奉監國改次長垣，是為江上潰後第一次監國入閩。