既然已经得到了朝思暮想的金羊毛，大家就回到了阿尔戈战船上。为了防止埃厄忒斯国王察觉到他们已经得到了金羊毛，大家决定趁着夜色赶紧离开这里。
可国王埃厄忒斯已经发现了金羊毛丢失的事情。他立马调集大军全力追击这些强盗。
国王之子亲率大军在海上航行了两天两夜，眼看就要追上阿尔戈号。
伊阿宋面临着一个迫在眉睫的问题。正在追击他们的科尔喀斯大军人多势众且装备精良，硬拼根本不是办法。
就在这时美狄亚有了主意。她对伊阿宋耳语道：“我有一个办法。请你在船上准备一场宴会。我会引诱我的弟弟前来。到时候你们杀死他，科尔喀斯人的大军便会群龙无首。届时我们就可以逃出生天了。”
“可是，那可是你的亲人……”
美狄亚早就和阿尔戈英雄是同一阵营的人了。到这个时候她不能再顾及亲情。
伊阿宋同意后，美狄亚用科尔喀斯语给弟弟写了一封信。信上说她自己是被这群强盗挟持走的，现在希望弟弟能把自己救走。她已经偷走了金羊毛，到时候哄骗这些人停靠在一个小岛上。她就可以想办法在这个岛上和弟弟见面了。
接到密使送来的信件，弟弟非常高兴。他按照姐姐的吩咐来到了约定的地方，正期盼着姐姐带着金羊毛归来，却被早已埋伏的伊阿宋一刀砍死。
失去了主帅，众人都以为科尔喀斯人会就此罢休。可他们失算了，科尔喀斯大军不愧是一群训练有素的士兵。他们并没有因为主帅的死而乱成散沙，而是依旧按照既定的作战方针紧追不放。
人算不如天算。神后赫拉的及时出手相救阻拦了这群凡人追兵。天空中顿时雷声滚滚，十分吓人。面对神灵的威吓，士兵们知道他们已经走投无路。因为临行前国王下的是死命令，现在国王之子也战死了，就算是回去也是死路一条。可前进的道路又有诸神的阻拦，于是士兵们最终选择停靠在一座孤僻的小岛上。
赫拉帮助阿尔戈英雄的事情惹恼了宙斯。宙斯在海面上刮起一阵飓风，将阿尔戈号吹到了陌生的地方。
英雄们不知道他们身陷何处，也不知道发生了什么。这个时候战船上供奉的雅典娜神像开口说话，为他们说明了情况：“你们的罪孽惹恼了神王宙斯。刚才的飓风便是对你们的惩罚。你们只能在海上漫无目的地漂泊了。”
“就没有办法了吗？”伊阿宋着急地问。
“除非你们得到魔法女神喀尔克的认可。她可以为你们洗清罪恶。”
大家别无选择，只好向众神祈祷，希望能够保佑他们早日见到魔法女神喀尔克。几天之后在赫拉女神的指引下，他们抵达了一座小岛。据说阿波罗之女魔法女神喀尔克就居住在这座岛上。
他们果然见到了正在海水中梳洗头发的女神。
为了洗清罪孽、摆脱宙斯的惩罚，伊阿宋和美狄亚下船去见喀尔克，其他人则留在船上待命。
喀尔克欢迎了这两位来客。伊阿宋便将他的一切和盘托出。
喀尔克盯着美狄亚的眼睛，觉得这种感觉非常熟悉。片刻之后，她发现了一件重要的事情——眼前的这个美狄亚也是阿波罗的女儿。所以说此时此刻远在科尔喀斯王国的埃厄忒斯并不是美狄亚的真正父亲。
美狄亚把自己的故事告诉给了女神。她故意隐瞒了自己伙同伊阿宋等人杀死弟弟的事情。可是这些事又怎能逃脱得了魔法女神的洞察呢。尽管喀尔克知道发生了什么，但她依然同情美狄亚的遭遇。
在魔法女神喀尔克的帮助下，一伙人的罪孽终于被洗清了。他们可以继续航行，但在路上不知不觉间来到了妖女所居住的海岛。
伊阿宋内心萌生出一种莫名的忧虑。他知道此刻英雄们归家心切，但前方是妖女的住处，稍有差池便会陷入万劫不复之地。
妖女是河神的女儿，从血液中诞生。妖女平时会像雕像一样蹲在海岸上。若是谁进入了她的领地，便会被她的魔音所控制，直到丧失神志。在她周围的成堆白骨就是厉害的证明。
当阿尔戈号靠近海岛的时候，一阵歌声传来：
过来吧，尊贵的异乡人
停住你的步伐，来我这儿看一看，休息休息…………
英雄们被这美妙的歌声所吸引，纷纷下到岸边，只有几个意志坚定的人没有受到歌声的干扰。那些被洗脑的英雄此刻面无表情地朝妖女的雕像靠近。
伊阿宋并没有受到外界的干扰。但他此刻心急如焚，根本不知道如何才能拯救这些陷入魔音之中的伙伴。
就在这时，俄耳甫斯弹奏起了古琴。他的琴声优美洪亮，很快就压制住了妖女魔音的影响。那些失去自我的英雄渐渐恢复了神志，仿佛从梦中惊醒一样，不知道刚刚发生了什么。
但是，来自雅典的波忒斯却依旧被妖女的魔音所吸引。他没能清醒过来，奋不顾身地跳进了大海，去寻找那吸引他的声音，从此一去不复返。
英雄们为不幸逝世的波忒斯进行了简短的默哀，然后继续上路。他们穿过了狭小而危险的海峡，来到了淮阿喀亚人的岛屿。他们的国王正是虔诚、善良、正直的阿尔卡诺尔斯。
在淮阿喀亚人的岛屿上，英雄们受到了热情的招待。可是还没等他们稍作休息，埃厄忒斯的第二波士兵就到达了这个岛上。
士兵的统帅来到阿尔卡诺尔斯的宫殿，对国王解释道：“尊敬的国王陛下，我奉埃厄忒斯国王之命前来捉拿要犯。您可能不知道您招待的这些客人在我的国家都犯下了什么罪行。”
于是他向国王讲述了这些人如何抢夺金羊毛及拐走国王女儿美狄亚的事情。英雄们在一旁也有些沉不住气，若不是当着国王的面，两拨人恐怕要在宫殿内厮杀起来。
国王听完这个统帅的讲述之后，决定让双方先回去休息，有什么事情第二天再说。
众人散去，美狄亚决定先发制人。于是她找到王后倾诉了自己的故事，还表明自己是自愿跟随伊阿宋走的。
王后非常同情美狄亚的遭遇，也被她的痴情所感动。她提出了一个建议，要伊阿宋和美狄亚尽快完成婚礼。因为这样子的话，伊阿宋就是美狄亚的丈夫，就连神灵也不能破坏这神圣的爱情和婚姻。任何人都无权让美狄亚离开自己的丈夫，因为一个已婚的女人应该和丈夫而不是父亲在一起。
于是当天夜里，美狄亚和伊阿宋就完成了婚礼。
第二天一早，三方势力都聚集在了洒满阳光的海岸上。这个时候，美狄亚向众人宣布自己已经和伊阿宋结婚的消息，并且还有证婚人作证。
最终，国王做出了裁决：“现在，美狄亚已经是伊阿宋的妻子。她有权和自己的丈夫待在一起，就连父亲也不能将她从丈夫身边夺走。至于其他人，他们有自己的自由。因此，我不会将客人们交给科尔喀斯人。”
事已至此，科尔喀斯士兵也都一言不发。很快，他们也做出了自己的决定。他们不再回去，而是留在了岛上成了这位正直国王的臣民，因为他们知道，自己若是无功而返，等待他们的只有死亡。毕竟国王埃厄忒斯的勇猛和残暴都是远近闻名的。
在岛上安稳休息一阵子后，英雄们装载着国王的礼物继续上路。阿尔戈号航行了三天三夜，家乡已经近在眼前。此时，一阵妖风将他们吹到了一座荒无人烟的小岛上。这里是非洲的利比亚。岛上一片沙漠，别说人了，就连苍蝇都看不到一只。
阿尔戈英雄们历经一路上的千辛万苦，却没想到在最后关头身陷此地，顿时哀号四起。就在众人绝望之际，伊阿宋又得到了神的旨意。原本平静的海面上突然掀起了一阵滔天巨浪。一只身形庞大的海马从海里冒出来，快速地跳到岸上，抖了抖身上的水朝远方奔去。
“这是神谕！大家快跟上！”
于是大家在伊阿宋的带领下沿着海马的足迹艰难跋涉。终于在沙漠里走了足足十二天后，他们来到了一个海湾。到这个时候所有人都累坏了，纷纷寻找水源补充水分。
俄耳甫斯独自一人沿着小路走着。他在路上遇见了夜神的四个女儿。俄耳甫斯用美妙的歌声询问仙女们哪里有可以饮用的水源。其中一位年长的仙女答道：“昨天，我们看守的圣林来了一个强壮的男人。他力大无比，一口气就将一块大岩石踢出了一道裂缝。更奇怪的是，大岩石的裂缝中居然流出来清澈的泉水。”
俄耳甫斯高兴坏了，在仙女的带领下找到了那块有裂缝的大岩石。他记住路线后便返回去招呼大家一起来喝水。
大家对于仙女口中的那个力大无比的男人很感兴趣。
其中一个人猜测道：“不会是赫拉克勒斯干的吧。也只有他拥有这么大的力气。”
其他人也觉得那人就是赫拉克勒斯。一想到昨天赫拉克勒斯还出现在这里，说不定今天也能遇见，于是大家赶紧去寻找他，但最终寻找无果。有一个人说看到了赫拉克勒斯的影子，刚想叫住他，他却消失不见了。
重整旗鼓之后，大家又开始出发。途中他们击败了拦路的巨人，这是他们的冒险之旅中的最后一个挑战。在这之后，大家便平安地进入了俄尔卡斯的海岸，回到了阔别已久的家乡。
伊阿宋将已经完成使命的阿尔戈战船献祭给了海神波塞冬。诸神将阿尔戈送上天空，变成了天上的南船座。
伊阿宋顺利取回了金羊毛。他的叔叔是否会按照约定将王位与权杖还给他呢？