1. 儿童急性腹泻
急性腹泻是指每日有3次以上的排便，且每次粪便均为稀水便，时间在2周以内，如果孩子出现急性腹泻的症状，合理使用益生菌可以缩短腹泻和住院的时间。
这种情况下，我们首选布拉氏酵母菌散和双歧杆菌三联活菌散，其次还可以选择双歧杆菌四联活菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒、酪酸梭菌活菌散剂、酪酸梭菌二联活菌散、地衣芽孢杆菌活菌颗粒、复合乳酸菌胶囊、双歧杆菌乳杆菌三联活菌片和双歧杆菌三联活菌肠溶胶囊。这些都是常规的益生菌，很容易购买和服用。
2. 儿童抗生素相关性腹泻（AAD）的预防
孩子在用抗生素进行治疗的同时，可能会出现抗生素相关性腹泻，也就是说，因为使用了抗生素，可能会出现肠道菌群紊乱，抗生素干扰糖和脂肪、胆汁酸代谢等问题，从而出现腹泻。合理使用益生菌可以明显降低与抗生素相关的腹泻发生率，也有助于减轻抗生素相关性腹泻的严重程度。
这种情况下，首选布拉氏酵母菌散、酪酸梭菌二联活菌散、双歧杆菌三联活菌散／胶囊、双歧杆菌乳杆菌三联活菌片，其他还包括酪酸梭菌活菌散剂、枯草杆菌二联活菌颗粒和地衣芽孢杆菌活菌颗粒。艰难梭菌相关性腹泻是AAD的一种严重类型，推荐使用布拉氏酵母菌散。
3. 儿童乳糖不耐受的治疗
很多孩子都会出现乳糖不耐受，所谓的乳糖不耐受，是指因为长期腹泻而导致的肠道内乳糖酶缺失，这时需要使用无乳糖奶粉（俗称“腹泻奶粉”）或者适当补充乳糖酶，益生菌辅助治疗婴幼儿乳糖不耐受时，可明显缩短疗程和住院时间。可以选择双歧杆菌乳杆菌三联活菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒、双歧杆菌三联活菌散和酪酸梭菌二联活菌散。
4. 儿童功能性便秘
有时候孩子出现便秘，我们通过检查，没有发现孩子的胃肠道有什么异常，但孩子就是出现了排硬干便，排便次数减少。这种没有明显原因的便秘，就被称为功能性便秘。
这个时候，就可以使用一些益生菌进行辅助。益生菌可以缩短粪便在肠道的运输时间，增强肠道的运动频率，明显改善排便的次数和粪便的黏稠度。此外，它还可以缓解排便的疼痛和困难，降低功能性便秘的复发率。
这种情况下，首选双歧杆菌三联活菌散，其次为双歧杆菌三联活菌肠溶胶囊，双歧杆菌乳杆菌三联活菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒、酪酸梭菌二联活菌散、布拉氏酵母菌散和地衣芽孢杆菌活菌颗粒。
5. 过敏性疾病
对于婴幼儿湿疹，很多妈妈只是给孩子局部外用一些药膏，但有时候会发现效果不太好，应注意婴幼儿湿疹的基本治疗原则是保湿，需要每日用很多的保湿剂来护肤，例如凡士林、硅霜等，同时可以使用益生菌作为辅助治疗，能够明显改善湿疹，提高疗效，降低复发率。
可以选择双歧杆菌三联活菌散、双歧杆菌四联活菌片、酪酸梭菌活菌散剂、枯草杆菌二联活菌颗粒、凝结芽孢杆菌活菌片、布拉氏酵母菌散和酪酸梭菌二联活菌散，一般需使用1个月。
6. 反复呼吸道感染的预防
对于反复呼吸道感染，需要给大家明确的是以年为单位，超过一定的呼吸道感染次数（每年5～7次），才能诊断为反复呼吸道感染，所以1岁以内的婴儿是不在诊断范围内的，益生菌可以明显减少呼吸道感染发生次数，缩短发热时间、咳嗽及喘息时间和抗生素使用时间。
推荐使用酪酸梭菌活菌散剂、酪酸梭菌二联活菌散和双歧杆菌三联活菌散，疗程2～3个月。
在此需要提醒大家的是，布拉氏酵母菌散在口服以后查便常规往往能查出真菌感染，所以在检查时应向医生告知孩子正在服用布拉氏酵母菌散，以免误诊。