劉伯溫聽說朱元璋想定都金陵，心中頗有幾分擔憂。南京本是龍盤虎踞的風水寶地，定都於此本是不二選擇，但是此地也正因為龍氣太盛，所以在曆史上風水被大幅度地破壞過兩次。
第一次風水破壞發生在戰國時期，那時候楚國滅了越國。楚王便派望氣士巡查越國故土，最後望氣士回稟說，南京這個地方天子氣鼎盛，日後必出帝王。楚王大驚，便根據望氣士的建議，在龍氣最旺盛的山下埋了一尊紫金金人，要以此鎮住龍氣，此山也就是後人所說的紫金山。
也許是南京王氣太盛的緣故，一尊金人根本鎮不住地氣。到了秦始皇時期，又有望氣士說南京出了天子氣。始皇帝大怒，於是挖山修河，憑空弄出了一條秦淮河，想以此弄壞南京風水。經此兩次折騰，南京的地氣終於被減弱了，定都此地的王朝不是偏安一方，就是國祚太短，難以超過百年。
朱元璋聽完劉伯溫的擔憂後，心中頗為不快。可是在當時的時空環境下，定都南京又是最好的抉擇。朱元璋思索良久，還是要定都南京，他命劉伯溫無論如何都要辦好此事。
劉伯溫硬著頭皮接下了這個差事後，便想再度改造金陵城的風水。他首先以南鬥接北鬥風水格局，修建了南京城北七南六共計十三座城門，這就好比在南京城罩上了一座天穹，能鎖住此地的地氣。
做了第一層風水改動後，劉伯溫緊接著做第二層風水設計，他命人放開了燕雀湖的湖水，在此填土修建皇宮。水為養氣之物，燕雀湖這地方如同氣眼一樣，在此修建皇宮，就能讓大明皇帝龍氣臨身。
做了前兩種變動後，劉伯溫仍不放心，南京城就如同一艘漂泊在大海上的小船一樣，雖然沐浴在龍氣之中，但是隨時可能被驚濤駭浪推走，必須想法子牢牢地釘在一個地方才行。船要停泊必須要放下鐵錨，南京城的地氣要穩定，也必須放下鐵錨一樣的東西。於是他又以皇宮為中心，在下麵挖了一個四通八達的地下皇城，名為金陵地宮。而作為鐵錨之物，就是五德生克石。就這樣，劉伯溫把秦始皇時期麵世的鐵芯秘密地放到了地宮之中。