“三大錯位”，首先是“大太後、小皇上”的錯位。自辛酉政變登台，到比光緒晚一天死去，慈禧獨掌晚清大權40多年，皇上見她要跪接跪送，大臣們見她膽戰心驚，是男權社會中的一大“異數”。
戊戌變法中，慈禧為變法劃了一條底線：“凡所施行之新政，但不違背祖宗大法，無損滿洲權勢，即不阻止。”⑴）可是，垂簾聽政本身就是違背祖製的錯位。對此，忠勇之士多次冒死提出批評。
甲午戰敗後，1894年12月18日，禦史安維峻上書：“皇太後既歸政皇上矣，若猶遇事牽製，將何以上對祖宗，下對天下臣民？”侍郎汪鳴鸞、長麟乘召見之機，提醒光緒：慈禧不過是先皇遺妾，與皇上“本非母子”，皇上應“收攬大權”。甚至連太監寇連才都看不下去了，冒死進言，泣請太後歸政，並說太後“不為祖宗天下計，獨不自為計？”更為可貴的是，戊戌事變已發生，白色恐怖已降臨，1898年9月23日，楊深秀拍案而起，獨上奏折，要求慈禧撤簾歸政……
雖然提出批評者無一例外地受到了殺頭或罷官等嚴厲迫害，卻說明了“大太後、小皇上”在當時是多麽地不得人心啊。
但是，也應看到，慈禧太後並不是變法的天敵，相反，她在洋務運動中，一直支持洋務派，明確表示：“變法乃素誌，同治初即納曾國藩議。派子弟出洋留學，造船製械，以圖富強也。”“苟可致富強者，兒自為之，吾不內製也。”戊戌變法開始時，她也是讚同的，《明定國是詔》，就是在她的批準下頒布施行的。據《周馥年譜》記載：“康有為屢上救時之策，大臣多保奏，上信任之。時太後退居頤和園，不與政，但囑上勿專信新進急切改圖而已。”可見，久曆政壇的太後對於光緒變法雖有告誡之詞，並無多少反對之意。