秦二世繼位不久，他們的篡權行為引起了諸公子和大臣們的疑慮。奸詐的趙高感覺到危機四伏，就對胡亥說：“沙丘之謀，各位公子和大臣們都有懷疑，憤憤不平，很可能要發生事變。為今之計，要用嚴刑峻法，將先帝的內臣以及諸公子清滅幹淨。然後收攬重用前朝遺留下來的民眾，對於地位卑賤的人，使他變得高貴；對於貧困的人，使他變得富足；對於前朝被疏遠的人，給予親近寵信，這樣就能實現上下團結而使國家安定。”
二世皇帝說：“這個辦法很好。”
於是胡亥開始密謀誅殺那些對他們心懷不滿的大臣、公子。胡亥有兄弟姐妹數十人。經過與趙高共同策劃，胡亥羅織罪名，首先將六位公子殺死在杜縣。隨後又在鹹陽的街上公開處死十二位公子。公子將閭等兄弟三人被囚禁在內宮中，因為等待議定他們的罪名被單獨拖延在後。二世皇帝派使者對將閭說：“公子不臣服君上，你的罪過應當處死，官吏將要來執行法令了。”
將閭說：“宮廷的禮法，我從來不敢不順從讚禮官的引導而妄為；朝廷上的位次，我從來不敢失節錯亂；領受皇帝的命令回答提問，我從來不敢失言錯答。依據什麽說我不臣服？我希望能夠明白地知道我所犯的罪過，再接受死罪。”
使者說：“我不可能參加謀議，隻是奉詔書行事。”
將閭於是仰天大呼：“天啊！我沒有罪！”
最後兄弟三人被迫含恨自殺。公子高見勢不好，準備逃跑，卻又怕牽連家屬滿門被斬，於是主動上書，請求為秦始皇殉葬。見到公子高主動求死的奏書，胡亥大喜，準其請求，並賜錢十萬用來安葬。胡亥對姐妹們也不放過，將她們殘酷殺害。
大臣中的心腹之患是蒙恬兄弟。當時接到偽詔，扶蘇拔劍自刎，而蒙恬不肯，被使者逮捕，囚禁北郡陽周。自蒙恬的祖父蒙驁起，蒙氏家族世代為秦名將。蒙恬本人為秦國掃平群雄出生入死，屢建奇功。統一六國後，蒙恬率兵三十萬，北逐匈奴，收複河南地（今內蒙古河套一帶），又負責修築長城，聲威赫赫。蒙恬有個弟弟叫蒙毅，過去深得秦始皇的賞識，常跟隨在秦始皇的左右。有一次趙高觸犯秦法，秦始皇將他交給蒙毅處治。蒙毅秉公執法，依秦律判處趙高死罪。可當蒙毅將判刑結果上奏秦始皇時，秦始皇卻因寵愛趙高，赦免了他。此後趙高對蒙毅恨之入骨，發誓要報仇雪恨。