誰也沒能想到，曹天舉被害案的幕後黑手是吳軍。
事情還得從運達集團說起。當時，曹天舉通過透水事件，將鷹凹山煤礦拿下後，請專家對周邊進行了細致的勘探，發現煤層儲量大得驚人。為了大規模開采，他必須投入3到5億的資金才行。通過何東陽的協調，銀行全部貸款加上他自有資金，也還差很多。曹天舉想到了合作開發，可苦於沒有合適的合夥人。那時候，羅永輝主管工業，吳軍作為服務羅永輝的副秘書長，就找到曹天舉，說山西有一大老板，願意出巨資合作開發。曹天舉自然樂意，於是展開了前期的談判工作。這期間，吳軍作為市政府副秘書長，在曹天舉與山西大老板之間溝通斡旋，初步達成協議。很快雙方簽訂了合同。第一步，雙方各出資6000萬購買世界最先進的采煤設備。吳軍覺得山西煤業開采技術先進，就由山西大老板負責聯係設備，不久，就與美國加州一家生產廠商簽訂了購買合同。所有的證件、文本等資料，曹天舉都是通過吳軍請的律師把關。自己很快就將6000萬打到了新開的帳戶上。一個星期後，吳軍突然來找曹天舉，說：“山西大老板聯係不上了。”
曹天舉說：“不可能，你繼續聯係。”曹天舉盡管這樣說，但心裏還是不踏實，馬上去很銀行查那筆款，款已被提。不可能，設備還沒提，怎麽先付款了？銀行的答複是手續齊全。曹天舉突然覺得事情不對。馬上找吳軍商量。吳軍說：“走，我們去趟山西，他跑了和尚還能跑了廟？”
一趟山西，讓他們倆徹底絕望了。按照合同上公司所在的城市和地址門牌號，找到後卻發現是一所學校。最後到工商局一查，以前確實存在過這麽一家公司，可不久剛剛注銷。從山西回來，曹天舉準備馬上報案。可吳軍堅決不同意，說：“你說得輕鬆，你一報案，讓我怎麽辦？”吳軍知道，他作為副秘書長，對此負有不可推卸的責任，整不好，這個副秘書長就當到底了。