朱元璋对接班人朱标的安排，可谓煞费苦心，他所做的一切事情，几乎都是为了朱标能顺利接他的班。对功臣群体的大清洗是这样，对各路王爷的严格规定也是这样。在很多人眼中，这样的父亲是合格的；可在朱标眼中，这样的父亲很不合格。
据史料记载，父子二人第一次发生矛盾是在1374年，当时朱元璋最喜欢的一个小老婆去世了。朱元璋很是悲痛，用隆重的葬礼送这位美人归西。同时，他希望朱标用对待死去老娘的礼节来对待这位香消玉殒的美女，朱标却死活不同意。他的理由是：“你这个小老婆又不是我亲妈，我为什么要按对待亲妈的礼节来对待他？”
朱元璋流泪说：“你这个畜生怎么如此没有人情味？她虽然不是你亲妈，可也是你小妈啊，总之就是妈!”
朱标说：“我就不。”
朱元璋化悲痛为愤怒，当着众大臣的面抽出宝剑，要砍了朱标。朱标虽然是个大胖子，但跑起来就和神行太保一样快，朱元璋追了半天，累得气喘吁吁也没有追上。
朱标扭头一看，发现老爹累得直喘粗气，就停下来说：“老头儿，你要拿剑砍我，我肯定会跑；如果你拿根棍子，我就站着让你打。”
这句话把朱元璋气笑了。众臣本来还很紧张，发现父子二人居然还开起了玩笑，就都跟着笑起来。
其实，朱元璋经常追着朱标要揍他，有时候拿的是宝剑，有时候拎的是棍子，但无论他手里的武器是什么，他从来没有追上过朱标。这样的次数多了，很多大臣发现，两人的“你追我跑”，其实是只属于父子之间的游戏。
朱元璋常常以朱标的名义，派遣使者到各路王爷那里视察慰问。如果发现有王爷违规，他就以自己的名义给予他们惩罚；如果发现王爷们做出了成绩，或者是品德不错，就以朱标的名义嘉奖他们。这一招数，让朱标在家族中的地位得到了巩固。
朱元璋的次子朱樉被封为秦王，就藩于西安。有一次，使者回来说：“秦王只有一个老婆，居然没有小老婆。”
朱元璋看了眼朱标说：“你好像也是这样，你俩是不是有病？”
朱标说：“老头子，我们都注意养生，不像你……”
和往常一样，朱元璋抄起身边的棍子就要打朱标。朱标话还没说完，赶紧从椅子上跳起来逃跑，眼看着就要被朱元璋追上。朱标此时急中生智，从怀里抽出一个卷轴丢给了朱元璋。朱元璋停下来，打开卷轴，发现卷上所画的内容，正是当初马秀英背着他逃跑的情景。
他不禁鼻子一酸，扔掉了棍子，看着远远跑掉的朱标，眼眶湿润。就在眼泪马上要流下来时，他忽然又笑了。
满朝文武其实都看得出来，朱元璋和朱标之间父子情深，发生的各种“矛盾”只是两人以插科打诨的形式，呈现出来的父子深情罢了。所以，没有人敢对朱标无礼，因为他已经命中注定是未来的皇帝。
未来的皇帝毕竟不是现在的皇帝，朱标有时候还是要向最高权力——现任皇帝低头。1380年，胡惟庸案爆发，朱元璋大肆株连屠杀功臣时，朱标见杀的无辜之人太多，就出来劝谏说：“杀有罪之人乃天理，杀无罪之人乃灭天理!”
朱元璋拿起一根长满了荆棘的棍子，扔到地上，对他说：“把它捡起来。”
朱标一看，这玩意儿必须戴上手套才能捡。他一时无从下手。
朱元璋捏起那根棍子，抽出宝剑，三下五除二把上面的荆棘全部砍掉，再次扔到地上，说：“把它捡起来。”
朱标很轻松地就把棍子捡起来了，朱元璋得意扬扬地说：“这根棍子，就好比是皇权；我杀的那些人，就是棍子上的荆棘。你如果想掌控皇权，就必须去掉这些荆棘。”
朱标叫起来：“这是什么狗屁比喻？荆棘不是凭空长出来的，肯定是棍子本身有问题。因为古人说过，上有尧舜之君，下有尧舜之民；上若是桀纣之君，下必是桀纣之民。”
朱元璋也叫起来，一面叫，一面从朱标手中抢过那根棍子，怒气冲天地说：“你敢说我是桀纣，我揍死你!”
朱标扭头就跑，一面跑一面叫着：“你不杀人，就是尧舜。”
朱元璋这回真来了气，任何一个恶人都不喜欢别人称他为恶人，这是人的本性。他用尽浑身力气，眼看就要追上大胖子朱标了，朱标突然喊了一声：“老妈，救命啊!”
朱元璋闻听此话，像踩了急刹车一般停下来，眼睁睁看着大胖子朱标跑远了。
在朱元璋看来，朱标的那一套尧舜之君尧舜之民的说法只是纸上谈兵，没有人会心甘情愿居于人下。人的欲望是无穷的，即使是在尧舜时代，也有共工那样的恶棍。若想长治久安，就必须清除那些毒瘤。指望用仁义道德化解毒瘤，这是痴人说梦。
在朱标看来，朱元璋在后宫中是慈祥的老爹、合格的丈夫；可一到朝堂，他就好像中了某种妖术，变成了截然相反的冷血暴徒。
朱标怎么也想不明白，自己为什么会有这样一个漠视人命、不知慈悲为何物的老爹。有这样一个老爹也就罢了，竟然还有一个那样善良的老娘，这两个人到底是怎么凑合到一起的呢？
这是个谜，也不需要解开，因为朱标的命运马上就要出现拐点了，它将拐到一个他老爹朱元璋永远不可能想到的方向。
1389年，秦王朱樉被朱元璋从西安调回南京，要他担任宗人令(主管朱氏皇族的机构)。很多心机深沉的大臣都觉得朱元璋这一手的背后有不可告人的目的。就连朱标都认为，老爹朱元璋可能是烦透了自己，打算废掉自己的太子之位。
朱元璋得知朱标的这种担心后，马上把他叫到面前，看着他胖嘟嘟的身材，哀叹着说：“你怎么会有这样的想法!”
朱标假装惊讶，问：“什么想法？”
朱元璋说：“你记住一句话，无论是朱樉还是朱棣，抑或是你的其他弟弟，他们都只是皇帝的儿子；而你，是我朱元璋的儿子。”
朱标这回可被震到了：皇帝的儿子和朱元璋的儿子，有什么区别!？
然而，他转念一想，就明白了这句话的玄妙所在：父亲爱儿子，是天经地义的；但皇帝爱儿子，却是社会角色大于父亲角色。朱元璋这句话的意思很明白——朱标永远是他最喜爱的儿子。因为他皇帝朱元璋有很多儿子，而父亲朱元璋，只有他朱标这一个儿子。
但是，朱标能放下心来吗？到了李善长案爆发时的1390年，朱标的心又开始提了起来。