不久，傑羅姆開始大張旗鼓地清理亞曆山大城的知識界。在他召集的三百人公眾集會上，那些“未經修訂”的書籍被大火焚毀，不相信“上帝可證”的學說被公開銷毀，具有諷刺意味的是，“希帕提婭的學生”不遺餘力地批判著他的老師，驅逐與她相關的一切學說與學者，六翼天使神廟也不能幸免。彼得帶領一群暴徒衝入了神廟，輕車熟路地翻出了希帕提婭的罪證：一些她注解、修訂過的科學、哲學著作、神秘主義的“黑暗學說”，一些精妙的化學實驗設備、天文觀測儀器……神廟的大理石柱正在簌簌戰栗，那曾經冠蓋雲集的熱鬧場麵已**然無存。希帕提婭關閉了她的學堂，主動斷絕了與總督大人的交往，以免引起基督徒們不必要的聯想。我時常想，如果我的老師閉門研修自己的學問，就能回避那複雜的人群、喧囂的聲音該多好。
四旬齋的三月裏，越來越多的跡象在暗示希帕提婭危險的處境，起初是敘內修斯潛回亞曆山大，勸說希帕提婭皈依基督教。而他本人，已經在羅馬受洗入教了。希帕提婭委婉地拒絕了他的好意，她沒有解釋原因；到了三月中旬，基督徒們的憤怒愈演愈烈，有謠言說是她阻撓了總督大人與主教大人之間的關係；再後來，總督大人又一次托人轉告她，勸導她離開亞曆山大，我也無數次哀求她逃離這混亂之城，她均拒絕了。我無法理解她的邏輯，不久前還是她請求與我一同逃亡海外，而此時，她卻懷著一個殉道者一樣的執著與平靜—我的老師似乎已經預知了她的生命軌跡，正如她對日月星辰運行軌道的了然於心。
三月下旬的一天深夜，希帕提婭站在空****的石階上，月光的清輝把大理石柱照得雪白。我坐在平時講堂上習慣的位置，用星盤觀測著星辰的角度。她讀著表盤上的數字，對比著往年的記錄，憂心忡忡地說：“如果托勒密是對的，為何金星和木星均有一年周期呢？”