李鴻章接到吳毓蘭的報告，真是一喜一惱。喜的是賴文光終於就擒，沒有溜掉。惱的是這樣一件大功，竟然由吳毓蘭唾手而得。六弟長途追趕，竟然沒有追及。還有劉銘傳的淮軍，興師動眾南下，被賴文光甩下四百餘裏，想為他鋪敘戰功也無從下筆。有一位新入幕府的文案出主意：“大帥要想照顧全局，隻有讓吳知府重新詳細報告捕獲賴文光的經過。”文案所說的重新報告，其實就是編造賴文光戰敗才被俘的謊言，這樣無論對哪一方，請功都比較方便。
李鴻章一聽文案的建議很好，立即派他南下揚州，找吳毓蘭密商。吳毓蘭知道是李鴻章的意思，一切按文案的建議重新編造捕獲賴文光的經過。文案帶著文稿，立即返回，李鴻章則於當天立即出奏《生擒賴逆東撚肅清折》。奏折開頭，鋪敘劉銘傳等軍一路追剿，賴文光損兵折將，走投無路，最後終於就擒。就擒的經過已經不是自投羅網，而是一番苦戰的結果：
據派防揚州之統帶華字營淮勇即選道吳毓蘭稟稱：十一日戌刻，賊眾突至灣頭，立即出隊迎擊獲勝，星夜派兵四路趕追。該道督遊擊梅宏勝、參將杜長生、守備吳輔仁由運河東岸向前追殺，遇賊於瓦窯鋪。雨夜昏黑，逆騎數百拚死拒戰。五更時，該逆縱火燒屋，誌在逃逸。我軍冒雨直前砍殺，吳毓蘭於火光中望一騎馬老賊手執黃旗指揮，知是逆首，連放數槍，賊馬倒斃，當將該逆生擒，餘紛紛投河淹斃並擒賊眾三十餘名，東路一股剿滅無遺。訊據賊眾指認生擒者，實係逆首偽遵王賴文光，該逆自認不諱。
接下來，李鴻章的奏折以洋洋數千言回顧了與撚軍作戰的艱難曆程，恭維朝廷上自兩宮、下至軍機大臣運籌帷幄，稱讚曾國藩的艱辛備嚐，當然，更曆數了以劉銘傳為首的淮軍數次大戰的功績。特別提及壽光彌河、洋河之戰，“劉銘傳、郭鬆林、楊鼎勳追七十餘裏始得接仗，戰至十數回合，又追殺四十餘裏，斬獲近三萬人，賊之精銳、騾馬、輜重拋盡。蓋軍興以來，罕有之事。將士回老營者，臣親加撫慰，皆麵無人色，其饑憊勞苦誠可憫矣。”這樣鋪敘的目的，便把吳毓蘭的功勞盡可能地衝淡，而最終捕獲賴文光，也是眾淮軍苦戰窮追的結果。