企业的自主创新是通过有效的技术创新机构来具体完成的。一般把能使知识变成技术的现代化实验室，称为技术创新的孵化器，也就是企业进行自主创新的主要机构。这里的实验室是一个统称，它包括了各种技术创新中心、技术研发中心等。知识转化成技术，需要有现代化的一流的实验室作保证。没有一流的实验室和实验设备，再出色的技术人才也不可能创造出新技术。因此，企业在自主创新过程中，必须重视创新机构的建设，为技术人才提供良好的创新环境。
不过，现在好多地方政府对此理解错了，把技术开发区理解成技术创新的孵化器，认为只要建成开发区，技术人才就有了创新的环境，就可以产生新技术了，于是，在建立技术开发区后，给海外留学生写信说，你们回来吧，我们这里有孵化器，但是留学生回来一看，发现只有一些地和房子，没有现代化的实验室，结果又走了。因此，高科技开发区不能简单的等同于技术创新的孵化器，实验室才是企业自主创新的机构。
实验室的建设，实际就是技术创新中心的建设，需要形成实验室经济。实验室经济是以实验室研发为中心，形成实验室产业，吸引社会各个方面的投资，为自主创新提供资金、人才、市场等。实验室作为产业投资方向，必然会带来分配制度的企业化，优秀科研人员的报酬会很高，从而激励他们献身于实验室，研发出大量的原创技术。目前，我国没有完整的实验室经济，技术人员比较浮躁，过分追求短期收益，弄虚作假之风盛行，自主创新缺少良好的机构保证。
实验室作为一种经济形态，应该具有以下特征。第一，投资主体多元化。实验室可以吸引社会投资，是一种多元化的投资载体，投资者不需要了解实验室的机密，也不需要干预实验室的运行，只需要追求投资回报。第二，运行企业化。实验室的运行是一种企业的经营过程，以追求经济效益为核心，是自主经营和自负盈亏的经济实体，不是一种没有经济活力的行政机构。第三，分配效率化。实验室的分配原则强调效率，而不强调公平，优秀的科技人员是高收入者，各种要素充分流动，从而保证分配效率的持续可行。第四，产出技术化。实验室生产的并不是某种产品，而是技术，将技术创新作为自己的主要产出目标。第五，主体市场化。实验室是一个市场主体，将满足市场需求作为自己的发展方向，即使是国家保密的实验室，也可放开自己的市场，因为市场所需要的是某种技术，而不是要了解实验室的秘密。第六，发展社会化。实验室不是一种自我封闭的体系，而是与社会各界有着充分的联系，包括资金联系和市场联系，为社会上的各种客户和各种投资者服务。