俗話說，天無絕人之路。當章太炎陷入深深絕望之中時，袁世凱自作自受，搞帝製、搞複辟，終於天怒人怨，眾叛親離。袁世凱鬱悶至極，急火攻心，於1916年6月6日一命嗚呼。
袁世凱死後，副總統黎元洪順位接任大總統。黎元洪是章太炎心目中的一尊神，是道德完人，是大政治家。而黎元洪對章太炎也充滿感激，畢竟在民國眾多政治家、政客中，隻有章太炎這樣看重他，而章太炎又是那樣有名的國學大師。所以，黎元洪就職後不久，章太炎也就恢複了自由。章太炎立馬從大總統袁世凱的階下因，變成大總統黎元洪的座上客。
6月12日，黎元洪親訪章太炎，問經國大計。章太炎對以開國承業，與民更始，第一以去小人為務，第二宜大開黨禁以廣言路。還泛論國勢人才以及一些具體事項。黎元洪表示獲益良多。
近君子而遠小人，是中國傳統政治的基本原則，也是領導者始終難以做到的事情，所以總是需要諍友不斷提醒。章太炎對袁世凱有許多不滿和意見，其實歸納起來，很多意見都不是對著袁世凱個人，而是袁氏身邊的“佞臣”。他在辭去東三省籌邊使時要求袁世凱除去梁士詒、陳宦、段芝貴和趙秉鈞所謂“四凶”。即便到了“二次革命”爆發，章太炎依然沒有對袁世凱個人多加指責，而是建議南方革命黨人將鬥爭矛頭對準梁士詒、陳宦、段芝貴、王賡、陳漢第、熊希齡和趙秉鈞7人。這也是中國傳統政治的“清君側”，所以當“二次革命”失敗後，章太炎還敢坦然進北京，因為在他思想深處，確實並沒有將袁世凱作為主要的鬥爭對象，盡管他曾不止一次想用黎元洪替代袁世凱。
現在黎元洪執政了。相應的，章太炎也就成為——帝王師了，隻是章太炎出的第一招就不太合乎當時的氛圍，所以這一招實際上沒有被采納。