文明十八年（公元1486年）元夜寅時上刻（3時左右），頭戴烏帽子、身披甲胄、外罩素襖的缽屋賀麻黨一行，高唱萬歲、敲著太鼓，來到了月山富田城下。因為這是每年的慣例，城兵未加詳細盤查就放他們進城了。賀麻黨中隱藏的尼子經久及其部下一進城就四麵放火，然後突然襲擊前來救火的城守兵。月山富田城中大亂，鹽冶掃部介自殺——就這樣，僅僅被追放3年後，尼子經久重新成為月山富田城主，時年為29歲。
陰陽一太守
取得月山富田城的尼子經久，開始重新征服雲州的戰爭。此時，擺在他麵前的最大障礙，就是威望素著並且實力強大的三澤氏。尼子經久擊垮三澤氏的經過，也許經過後人的反複渲染和加工——因為，實在是太過精彩和戲劇化了。
尼子氏複國的第一功臣山中勘兵衛因為頂撞尼子經久而被判死罪，狼狽逃往三澤氏的領地。經久大怒，將勘兵衛的妻子和老母下獄牢係。勘兵衛出仕三澤氏，前後兩年，忠勤無匹；兩年後，他向三澤氏家督為國哭訴經久的殘暴，說：“請求借給我一支兵馬，潛向月山富田，城內有我的故交，裏應外合打開城門，就可以救出我的家人，也能給尼子氏以沉重打擊。”三澤為國大為感動，將大半兵馬交付給他。勘兵衛統兵來到富田近邊待機，暗中通知尼子經久，經久立將1千兵馬來迎，並於敵後安排埋伏，前後夾擊，三澤軍大敗。不久以後，經久又進軍包圍了三澤氏本城，主力盡失的三澤為國被迫出城投降。
三澤氏既已降伏，其他的國人領主，如三刀屋、赤穴等，都先後歸降尼子經久。經久很快就重新平定了出雲，並開始向外擴張。
就在尼子氏勢力逐步擴大的時候，其主家京極氏卻已經走到了滅亡的邊緣。京極家督政經與其弟高清爭奪近江守護失敗，逃到出雲，於永正元年（公元1504年）去世。政經死前，把嫡孫吉童子丸托付給尼子經久和多賀經長。吉童子丸尚幼，經久很快就把出雲守護的頭銜握到了自己手裏（一說到其孫晴久的時候，尼子氏才正式得到這一職銜）。
當時西國最大的勢力，乃是大內義興。尼子經久在安藝諸豪強的幫助下，逐步擴展勢力，欲與大內氏一較短長。永正九年（公元1512年），經久命令備後鬆永的古誌為信牽製大內進軍。5年後，趁著大內義興入京的機會，他親統大軍，從備後山內方麵南下；與此呼應，備中新見國經開始向美作進軍，伯耆的尼子久幸（經久弟）進軍牽製大內方各國人領主，安藝守護武田元繁從大內氏側背展開擾亂行動，瀨戶內海由杉內氏擊破大內水軍。等到大內義興匆忙趕回防、長，局勢已經變得幾乎不可收拾了。
在此前的永世十年（公元1513年），尼子經久與嫡子政久一起進攻大原郡阿用城的櫻井宗的。因為敵方城池堅固，經久決定采取長期包圍的策略。政久恐怕將兵在外，士氣低落，每夜在城下吹笛，此事被櫻井宗的探知，事先準備好大弓，某夜引弓一發，正中政久咽喉。尼子政久當場斃命，年僅26歲——後來武田信玄夜聽吹笛被鐵炮所傷的傳說，懷疑即此事的附會。
大永元年（公元1521年），大內、尼子雙雄在石見展開大戰，勝負的關鍵乃是石見國吉見、益田、福屋等有力的國人領主之向背。這些國人好像牆頭草一樣來回搖擺，經久此次決定幹脆強攻，一舉解決這一問題。首先，尼子經久攻擊都治駿河守的今井城；次年（公元1522年），又攻克福屋一族的乙明城。大內氏派遣的援軍與尼子氏得勝之師在濱田決戰，難分勝負，隻得議和退兵。
而此時在山陽道方麵，大內氏名將陶隆房攻克安藝武田氏的鏡山城，已故的武田元繁之後繼武田光和再次臣服於大內氏。安藝豪族毛利元就在判斷了雙方實力後，決定背叛大內氏，跟從尼子經久，複奪鏡山。元就施計，說降了城將藏田房信的叔父，終於使尼子方大獲全勝。經過此戰，尼子經久看到了毛利元就智謀的可怕——雖然當時還預料不到，輝煌的尼子家族將會覆滅在此人手上……
且說尼子經久，當時掌握著山陰、山陽兩道十一國守護職，人稱“陰陽一太守”。尼子的最盛期在他手上，衰亡的發端也由他開始。他曾將鹽冶的3千貫領地分給三男興久，興久貪得無厭，更要求加增家老龜井秀綱的七百貫領地。秀綱聽聞此事，在經久麵前屢進讒言，尼子興久惶恐之下，遂於天文元年（公元1532年）揭起叛旗。父子雙方在佐陀城交戰，興久戰敗，重臣米原小平內、龜井利綱等均歿於陣。興久逃依嶽父、甲山城主山內直通，尼子經久派黑正甚兵衛追擊，包圍甲山，迫使興久自殺。
經此內亂，尼子氏勢力衰退，安藝國的有力國人領主，熊穀、宍戸等先後被毛利氏懷柔，山內直通等因怨恨尼子經久殺子的行為，也聯絡了三吉、多賀山等家族降伏於毛利元就。天文五年（公元1536年），尼子軍展開反擊，一口氣攻克備後、安藝、石見等各處叛反舊領。諸戰中，經久嫡孫尼子詮久奮勇當先，甚至突入美作國，擄得大片土地。於是次年，經久將家督之位讓於詮久，自己退居二線——此時經久80歲，詮久24歲。
尼子詮久（後改名晴久）乃是一位豪勇之將，他即位初，就從大內氏手裏奪回石見銀山城，隨即擊破播磨守護赤鬆政村，並將之放逐，又攻克別所就治的三木城，所向披靡。天文八年（公元1539年），尼子晴久計劃討伐重歸大內的毛利氏。他不顧諸將反對，準備傾重兵殺向安藝吉田郡山城。叔祖尼子久幸急忙跑去和病榻上的經久商議，經久喚來晴久責問，但晴久隻用“臆病野洲（久幸任下野守）”一句就冷冷地頂了回去。
郡山和富田的合戰
天文九年（公元1540年），“新宮黨”尼子國久統率3千兵馬，通過備後入侵安藝，但在犬飼平戰役中遭到宍戸一族的頑強抵抗而敗退。尼子晴久斥退國久，自為統帥，進攻安藝的毛利勢。他命久幸、國久等一門眾，召集雲、石、耆、幡、作、備中諸國共3萬大軍，幾乎傾巢而出，誓將毛利氏一舉踏平。
毛利氏當主元就得報，急忙收攏軍隊，有眾8千，準備憑堅固守，同時派遣使者向大內氏求救。九月六日，尼子軍殺入石州口，放火燒盡了城下町，隨即包圍毛利氏的主城吉田郡山。十二日在大田口方向展開激戰，尼子方本城信濃守、高橋元綱戰歿。二十三日，尼子晴久中了元就的反間計，放棄要害風越山，而將本陣轉移到青山、三塚山一線。
大內氏發兵救援安藝，二十六日，尼子侍大將湯原宗綱為先陣攻擊大內軍，遭到毛利軍出城夾擊而慘敗。宗綱喪生，留下“腹切岩”的古跡。
眼看形勢不妙，十月十一日，尼子晴久以一門眾誠久為先鋒，向吉田郡山城發起總攻。毛利元就放棄籠城，出兵在土取橋與敵決戰。雙方正在激鬥，元就又出奇計，伏兵蜂起，尼子軍幾近崩潰，大將三澤為幸等為保護尼子晴久而當場戰死。晴久被迫後退，戰局再度陷入膠著狀態。十二月三日，大內氏名將陶隆房率援軍一萬前來相助，籠城方士氣更為高漲。
次年（公元1541年）正月三日，最終決戰開始了，毛利、大內聯軍反複突入，火燒尼子軍陣屋。十三日，聯軍猛將吉川興經統率3千兵馬奇襲駐紮在長尾地方的尼子軍陣，守將高尾豐前守戰死，黑正甚兵衛亡命奔逃。陶隆房趁著尼子諸軍前往救援長尾的機會，突襲尼子本陣。尼子晴久已經做好了戰死的準備，多虧叔祖下野守（就是被晴久斥罵為“臆病野洲”和“尼子比丘尼”的尼子久幸）的苦諫才被迫撤離。久幸欣慰地看主君安全離去，才率深野房重等十數騎直衝陶軍，力盡而亡。久幸用兵謹慎，也有“避戰將軍”之名，素來被晴久等年輕武士視為膽怯——戰陣之上，何者為勇，何者為怯，尼子晴久就算現在明白過來，也為時太晚了……
尼子敗兵在寒冬的深雪中一路敗逃，尼子久幸的首級也無人撿回。毛利、大內聯軍乘勝掃蕩整個安藝，臣從於尼子氏的各國人領主紛紛敗亡。病榻上的尼子經久聞聽敗訊，終於再也支撐不住了——歿於是年十一月十三日，享年84歲，和父親清貞同葬於洞光寺中。
尼子大軍敗退，毛利元就乘勝追擊，攻克佐東銀山，城主武田信實逃往出雲——一直夾在大內、尼子兩個大家族中間左右搖擺的安藝守護武田氏至此滅亡。
一年以後，即天文十一年（公元1542年），甲斐的武田晴信吞並諏訪的同一年，陶隆房鼓動大內義隆遠征出雲，一舉掃平尼子殘黨。大內方總兵力15萬，包括毛利、小早川、吉川等安藝豪族，浩浩蕩蕩向東方殺去。然而大軍行進遲緩，三月集中於石見，七月才攻克赤穴光清的赤穴城。十一月，風雪大作，大內義隆將本陣設在馬瀉的正久寺，而毛利元就父子則在白瀉地方安營過冬。
次年（公元1543年）二月，冰雪融化，大軍繼續前進，大內義隆本陣向經羅木山移動，毛利元就父子直取月山富田城，進出要隘菅穀口，並在蓮池繩手地方擊破尼子軍。
對應大內氏的進攻，已經無力反擊的尼子氏遂開始采取分化瓦解策略。四月末，大內方的數家強力豪族，包括三澤、三刀屋、本城等，甚至還有毛利元就的外甥（同時也是妻甥）吉川興經，都一起背叛大內家，而將軍隊開入月山富田城，協助尼子勢防守。眼看雙方的勝負天平突然傾斜，大內義隆無奈，隻得倉皇撤軍。尼子軍於後掩殺，大內軍大敗虧輸，而隻有經石見路歸國的毛利元就因為防護得當，未受大損，安然撤回居城吉田郡山。
三年內兩次大戰，進攻方全都铩羽而歸，損失慘重，夾在兩大勢力間的毛利氏反倒趁機穩步壯大。“瀨戶內智將”毛利元就即將轉守為攻，創造比大內氏和尼子氏更為輝煌的業績！