卻說南北兩軍在長城一帶交鋒，北軍連戰連敗，最後北軍主帥梁王王禪，隻好率敗兵回到上都。朝野便立時陷入驚恐之中。雖然不久便傳來陝軍破關東出，連戰連捷，以及四川又有遙相呼應之聲，但那是遠水救不了近火，齊王月魯貼木兒率南軍已對上都形成了包圍之勢。泰定帝皇後聽到的敵軍漸至、己軍屢敗的消息，望著不諳事理的幼主和無計可施的眾大臣，不由得暗暗垂淚，整日裏唉聲歎氣，束手無策。
王禪再次率軍與南軍交鋒，仍是大敗而歸。又聞得遼東諸王已歸大都，便知頹勢難挽，大廈將傾，乃帶了一支人馬，假托夜間出城劫營，便逃之夭夭，自尋活路去了。
第二天眾人不見王禪回轉，心中更為恐慌。丞相倒剌沙見狀，決定改換門庭，以求富貴。乃密遣人出城與齊王聯絡，約期獻城。
次日，齊王率大軍來至城下，倒剌沙大開城門，親自捧著皇帝玉璽，率百官屈膝道旁，迎大軍入城。
隨著上都的陷落，曆時四個月的兩帝之爭，到此結束。剩下的就是如何對逆臣叛將的處置了。
文宗恨不得將這些叛逆之臣一個個斬盡殺絕，但許多諸王及大臣們都坦誠進言，認為天下初定，應以穩定大局為重，對叛逆之人要分別處理，以服人心。禦史中丞趙世延道：“對叛逆之臣不可不辦，亦不可不分青紅皂白一律嚴辦。首逆者從重嚴辦，脅從者從輕懲治，方能彰顯我主盛德，安天下人之心。”荊王也速也不幹道：“趙中丞所言甚當。一些地方將吏，誤從上都，或身不由己，朦朧出兵，陛下當寬大為懷，縱有罪惡，也隻宜奪官罷爵；至於一般脅從者，可分別不同情況，從輕發落，或不予追究，令其戴罪效力即可。絕不能弄得人人自危，以致禍亂又起。”
文宗從眾臣之言，依議將倒剌沙等一班叛逆首要分子，以及後來逮住的王禪處死；詔諭四川的囊加台息兵止武，重歸朝廷；對傳檄陝甘、起兵東犯的靖安王闊不花專詔切責，令其罷兵認罪，開恩仍保留王位；對陝西行省主要官員，如平章隻兒哈、探馬赤，行台禦史大夫也先貼木兒、禦史馬紮兒台等，予以削職為民等等。詔令一出，人心即安。