為了對付王陽明的剿匪官軍，盤踞在橫水、左溪的謝誌山、桶岡的藍天鳳找到廣東的高快馬，結成同盟主動出擊。謝誌山還製造出失傳已久的呂公戰車，批量生產，布置於各個關口，決意頑抗到底。他們還緊鑼密鼓地打造攻城器具，宣稱要進攻贛州的鄰縣南康。他們聲稱打下南康就打贛州，端掉王陽明的老窩。
正德十二年（1517年）七月二十五，謝誌山帶領一千多人跑到南安城下，推著呂公車發動猛攻。那呂公車又重又大，攻城卻毫無效果。一個月後，謝誌山和藍天鳳再次進攻南安城，也沒有得逞。官軍們拚死守住了南安城。
這兩股土匪氣焰居然如此囂張，王陽明決定對謝誌山和藍天鳳動手。為此，王陽明專門給王瓊寫信，希望朝廷授予他提督南贛軍務的專斷特權，南贛地區的所有軍隊包括周邊四省部分軍隊，由他來統一指揮，隻求作戰成功，朝廷不能規定時限。內閣批準了王陽明的請求。很快，正德皇帝朱厚照也準奏，令王陽明提督南贛軍務，可便宜行事。
於是王陽明開始改革軍隊指揮體製。士兵二十五人編為一伍，長官為小甲；二伍為一隊，長官為總甲；四隊為一哨，長官為哨長；二哨為一營，長官為營官；三營為一陣，長官為偏將；二陣為一軍，長官為副將。並設立牌符，上麵注明“某軍某陣某營某哨某隊某伍某甲某人”，平時由各級軍官檢查，一遇戰事，則憑牌符調遣。
此法治眾如治寡，所有將官都由王陽明本人任命，不需上報朝廷。軍隊實行層層管理，令行禁止，嚴格有效。這樣，一台精密而高效的戰爭機器形成了。
接下來，王陽明就開始清剿和招撫兩手並用。他令人發布了《告諭巢賊書》，發送給高快馬、池仲容等山頭土匪。他寫的這篇《告諭巢賊書》堪稱攻心奪氣的奇文。大意為：