嘉靖七年（1528年）九月，王陽明將平亂善後諸事安排妥當，決意離開廣西。
這個時候，他的病情已經非常嚴重，因咳痢之疾（肺癆）日益加劇，生命已近尾聲。他給嘉靖皇帝朱厚熜寫了《乞恩暫容回籍就醫養病疏》，訴說了每天麵對的病痛之苦，希望皇帝能允許他回籍養病。
在這篇奏疏中，王陽明詳細論述了他回去就醫的原因。說他在南贛剿匪時中了炎毒，導致他遍體腫痛，咳嗽不止，後來稍好，一遇炎熱就大發作。事實上，王陽明奉詔自浙江餘姚啟程前往廣西時，肺病就已嚴重惡化，夜裏持續咳嗽無法入睡，臉色青黑得猶如鬼魅。這次來廣西本來帶了醫生，但醫生自己卻先得病回老家了。他繼續南下，炎毒更甚，結果遍體腫毒，劇烈咳嗽日日不斷，無休止的咳嗽把整張臉都擠壓得變了形，腿上瘡傷的潰爛一天比一天嚴重。後來他連吃飯都費勁，每天隻能喝幾勺粥，稍多一點就嘔吐腹瀉。
可以說，這時的王陽明幾乎隻剩下半條命。他拚著這疲病羸弱之身完成了在廣西的平亂重任，可謂“鞠躬盡瘁，死而後已”。
實際上王陽明晚年無論是講學，還是帶兵打仗，都忍受著巨大的身體苦痛。不辭辛苦終日操勞，此番身心之苦非常人所能理解與忍受。而長期征戰與講學操勞，已經極度透支了王陽明的生命能量。
王陽明在廣西等來等去，沒有等到皇帝允許他告歸的詔書。到了九月份，才得到朱厚熜的嘉獎詔書：因廣西剿匪有功，賞賜五十兩白銀。而對於其他，朱厚熜和內閣隻字未提。
有關對將士們的封賞和一係列關於邊疆問題的建議都沒有下文。這區區五十兩白銀更像是一種調侃和嘲弄。
然而，王陽明還是掙紮著從**爬起來，遙望北方叩謝隆恩。接著，他又連夜寫了《謝恩疏》，八百裏加急送往京城，表示此生願鞠躬盡瘁以報皇恩。