1938年4月初，蕭軍與蕭紅在西安的八路軍辦事處正式分手。根據蕭軍的描述，蕭紅是微笑著跟他提出分手的，蕭軍表示同意，並沒有過多渲染他們的初識，以及在哈爾濱旅館度過的艱難歲月。
當然，根據給蕭紅寫傳記的作者，也是她生命晚期的好朋友駱賓基的說法，當時在哈爾濱那個旅館裏，也就舒群和蕭軍去看過她，當初可能並沒有像蕭軍描述的那麽具有文學性。因為駱賓基聽蕭紅聊過很多事、很多人，但最終蕭紅並沒有非常甜蜜、快樂或是濃重地講起她與蕭軍的第一次相見。
兩人分手之後，蕭紅很快明確了與端木蕻良的戀愛關係。端木蕻良也來自東北，他的出身和蕭紅有點兒像，也是地主家庭，但有些沒落了。端木中學、大學讀的都是名校，這一點跟蕭紅完全不同，他南開中學畢業，在清華大學念書，晚年研究紅學，寫《曹雪芹傳》，雖然早中年是一位文學家，但晚年更像一個學者。《蕭紅小傳》的作者駱賓基也是這樣的人，青年時期從事文學，晚年研究經文和古文，這也是從作家向學者的一個過渡。在這方麵，端木跟蕭軍是不一樣的。
同年5月，蕭紅與端木在漢口舉辦婚禮。8月上旬，因武漢形勢危急，日軍打過來了，端木獨自離開武漢前往重慶。9月中旬，蕭紅與另外一位女士結伴也去了重慶，在走到宜昌時同行的女伴吐血，蕭紅手足無措，幸虧當時船上有位《武漢日報》的編輯，幫忙把同伴送到了醫院。兩天後，蕭紅一個人到達重慶。而在兩個月後，她在重慶江津白沙鎮的一家婦產醫院產下一名男嬰，這就是蕭軍的骨血。但是不幸的是，這個男嬰在三天後就去世了。
1939年12月中旬，因為害怕重慶也會淪陷，端木蕻良和她一起去了香港。去香港，更多的是端木的主意，因為他在香港有個朋友，與張學良的弟弟張學明關係很好，在香港當地算是位富商，端木當時想去投奔這個朋友。但當時在重慶的一些朋友不建議他們去香港，但又沒集體挽留，事後蕭紅也比較後悔，說不該去香港。